扬州市职业大学体育学院办学历史可以追溯到1959年建校的扬州教育学院在1977年设立的体育系，也是江苏省恢复高考招生后第一个开设专科层次体育教育专业的院系。2007年扬州市职业大学与扬州教育学院合并办学成立了扬州市职业大学体育系，2012年又与扬州环境资源学院体育部合并成立扬州市职业大学体育学院。

体育学院秉持“办社会需要的专业，创体育教师培养的品牌，育全面发展的学生，当校园文化建设的先锋”的办学理念，紧跟时代发展的脉搏，面对市场需求，以学生全面发展为本，培养社会需要的体育专门人才。